MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus pyogenes str. Manfredo chromosome

Total Repeats: 32125

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009332	T	6	6	221	226	0 %	100 %	0 %	0 %	139472889
2	NC_009332	T	6	6	280	285	0 %	100 %	0 %	0 %	139472889
3	NC_009332	ATG	2	6	290	295	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472889
4	NC_009332	A	7	7	365	371	100 %	0 %	0 %	0 %	139472889
5	NC_009332	CTG	2	6	392	397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139472889
6	NC_009332	GAA	2	6	442	447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472889
7	NC_009332	ATCA	2	8	478	485	50 %	25 %	0 %	25 %	139472889
8	NC_009332	AGC	2	6	494	499	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472889
9	NC_009332	TGC	2	6	594	599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139472889
10	NC_009332	TTA	2	6	682	687	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472889
11	NC_009332	AT	3	6	738	743	50 %	50 %	0 %	0 %	139472889
12	NC_009332	TTA	2	6	758	763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472889
13	NC_009332	GAAA	2	8	807	814	75 %	0 %	25 %	0 %	139472889
14	NC_009332	TGA	2	6	843	848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472889
15	NC_009332	A	7	7	865	871	100 %	0 %	0 %	0 %	139472889
16	NC_009332	CT	3	6	874	879	0 %	50 %	0 %	50 %	139472889
17	NC_009332	AAG	2	6	887	892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472889
18	NC_009332	ATA	3	9	920	928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139472889
19	NC_009332	ACAA	2	8	929	936	75 %	0 %	0 %	25 %	139472889
20	NC_009332	ATC	2	6	965	970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472889
21	NC_009332	AGA	2	6	981	986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472889
22	NC_009332	CCT	2	6	1033	1038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	139472889
23	NC_009332	CAAA	2	8	1194	1201	75 %	0 %	0 %	25 %	139472889
24	NC_009332	TGC	2	6	1224	1229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139472889
25	NC_009332	GAA	2	6	1285	1290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472889
26	NC_009332	CTA	2	6	1343	1348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472889
27	NC_009332	TGG	2	6	1443	1448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	139472889
28	NC_009332	TAA	2	6	1479	1484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139472889
29	NC_009332	A	6	6	1539	1544	100 %	0 %	0 %	0 %	139472889
30	NC_009332	ATT	2	6	1738	1743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472890
31	NC_009332	TCA	2	6	1805	1810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472890
32	NC_009332	GTAA	2	8	1889	1896	50 %	25 %	25 %	0 %	139472890
33	NC_009332	TTA	2	6	1937	1942	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472890
34	NC_009332	T	7	7	1951	1957	0 %	100 %	0 %	0 %	139472890
35	NC_009332	ATT	2	6	1964	1969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472890
36	NC_009332	AAC	2	6	2010	2015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139472890
37	NC_009332	GTT	2	6	2021	2026	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139472890
38	NC_009332	AAG	2	6	2091	2096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472890
39	NC_009332	ATT	2	6	2131	2136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472890
40	NC_009332	TAT	2	6	2143	2148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472890
41	NC_009332	GTC	2	6	2184	2189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139472890
42	NC_009332	GACT	2	8	2248	2255	25 %	25 %	25 %	25 %	139472890
43	NC_009332	CAG	2	6	2298	2303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472890
44	NC_009332	GA	3	6	2335	2340	50 %	0 %	50 %	0 %	139472890
45	NC_009332	CAG	2	6	2346	2351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472890
46	NC_009332	GAT	2	6	2360	2365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472890
47	NC_009332	TTA	2	6	2474	2479	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472890
48	NC_009332	GTT	2	6	2501	2506	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139472890
49	NC_009332	CTT	2	6	2545	2550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139472890
50	NC_009332	GGTAA	2	10	2636	2645	40 %	20 %	40 %	0 %	139472890
51	NC_009332	AGTC	2	8	2666	2673	25 %	25 %	25 %	25 %	139472890
52	NC_009332	GAA	2	6	2804	2809	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472890
53	NC_009332	AATT	2	8	2820	2827	50 %	50 %	0 %	0 %	139472890
54	NC_009332	TAAG	2	8	2846	2853	50 %	25 %	25 %	0 %	139472890
55	NC_009332	TGAAA	2	10	2946	2955	60 %	20 %	20 %	0 %	139472891
56	NC_009332	A	6	6	2953	2958	100 %	0 %	0 %	0 %	139472891
57	NC_009332	ATG	2	6	3067	3072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472891
58	NC_009332	A	7	7	3099	3105	100 %	0 %	0 %	0 %	139472891
59	NC_009332	CAG	2	6	3460	3465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472892
60	NC_009332	GCT	2	6	3534	3539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139472892
61	NC_009332	TGGTA	2	10	3572	3581	20 %	40 %	40 %	0 %	139472892
62	NC_009332	A	7	7	3630	3636	100 %	0 %	0 %	0 %	139472892
63	NC_009332	AAAT	2	8	3710	3717	75 %	25 %	0 %	0 %	139472892
64	NC_009332	TGA	3	9	3770	3778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472892
65	NC_009332	TCAA	2	8	3876	3883	50 %	25 %	0 %	25 %	139472892
66	NC_009332	A	6	6	3904	3909	100 %	0 %	0 %	0 %	139472892
67	NC_009332	AGA	2	6	4016	4021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472892
68	NC_009332	GTT	2	6	4032	4037	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139472892
69	NC_009332	AAC	2	6	4055	4060	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139472892
70	NC_009332	CAAA	2	8	4130	4137	75 %	0 %	0 %	25 %	139472892
71	NC_009332	AGT	2	6	4169	4174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472892
72	NC_009332	AGA	3	9	4193	4201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472892
73	NC_009332	AGA	2	6	4229	4234	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472892
74	NC_009332	AGC	2	6	4286	4291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472892
75	NC_009332	ATC	2	6	4294	4299	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472892
76	NC_009332	CAG	2	6	4324	4329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472892
77	NC_009332	GCT	2	6	4383	4388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139472892
78	NC_009332	TAT	2	6	4391	4396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472892
79	NC_009332	ATG	2	6	4444	4449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472892
80	NC_009332	AAG	2	6	4483	4488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472892
81	NC_009332	GAA	2	6	4503	4508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472892
82	NC_009332	GTT	2	6	4521	4526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139472892
83	NC_009332	CAT	2	6	4538	4543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472892
84	NC_009332	TTG	2	6	4648	4653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	139472893
85	NC_009332	A	6	6	4681	4686	100 %	0 %	0 %	0 %	139472893
86	NC_009332	GAT	2	6	4752	4757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472893
87	NC_009332	TTA	2	6	4789	4794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472893
88	NC_009332	CTA	2	6	4822	4827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472893
89	NC_009332	AAT	2	6	4836	4841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139472893
90	NC_009332	CTA	2	6	4871	4876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472893
91	NC_009332	ATG	2	6	4909	4914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472893
92	NC_009332	TTACGT	2	12	4938	4949	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	139472893
93	NC_009332	CAG	2	6	4960	4965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472893
94	NC_009332	GAC	2	6	5041	5046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472893
95	NC_009332	TTA	2	6	5065	5070	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472893
96	NC_009332	ATA	2	6	5101	5106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139472893
97	NC_009332	TTTA	2	8	5152	5159	25 %	75 %	0 %	0 %	139472893
98	NC_009332	A	6	6	5176	5181	100 %	0 %	0 %	0 %	139472893
99	NC_009332	ATT	2	6	5221	5226	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472894
100	NC_009332	ACC	2	6	5267	5272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	139472894
101	NC_009332	GAT	2	6	5342	5347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472894
102	NC_009332	A	9	9	5349	5357	100 %	0 %	0 %	0 %	139472894
103	NC_009332	TGA	2	6	5422	5427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472894
104	NC_009332	T	6	6	5444	5449	0 %	100 %	0 %	0 %	139472894
105	NC_009332	TGA	2	6	5673	5678	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472894
106	NC_009332	T	6	6	5789	5794	0 %	100 %	0 %	0 %	139472894
107	NC_009332	GAT	2	6	5798	5803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472894
108	NC_009332	AAC	2	6	5850	5855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139472894
109	NC_009332	TTA	2	6	5868	5873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472894
110	NC_009332	GAT	2	6	5957	5962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472894
111	NC_009332	A	6	6	5963	5968	100 %	0 %	0 %	0 %	139472894
112	NC_009332	AGA	2	6	5977	5982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472894
113	NC_009332	A	6	6	5998	6003	100 %	0 %	0 %	0 %	139472894
114	NC_009332	ATT	2	6	6040	6045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472894
115	NC_009332	ATT	2	6	6064	6069	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	139472894
116	NC_009332	T	6	6	6098	6103	0 %	100 %	0 %	0 %	139472894
117	NC_009332	GAT	2	6	6104	6109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472894
118	NC_009332	GATTT	2	10	6138	6147	20 %	60 %	20 %	0 %	139472894
119	NC_009332	AGA	2	6	6169	6174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472894
120	NC_009332	ACT	2	6	6207	6212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	139472894
121	NC_009332	CTT	2	6	6256	6261	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	139472894
122	NC_009332	T	6	6	6338	6343	0 %	100 %	0 %	0 %	139472894
123	NC_009332	TTGA	2	8	6359	6366	25 %	50 %	25 %	0 %	139472894
124	NC_009332	A	7	7	6384	6390	100 %	0 %	0 %	0 %	139472894
125	NC_009332	AAC	2	6	6394	6399	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	139472894
126	NC_009332	ACGA	2	8	6432	6439	50 %	0 %	25 %	25 %	139472894
127	NC_009332	CCTT	2	8	6472	6479	0 %	50 %	0 %	50 %	139472894
128	NC_009332	AGTG	2	8	6481	6488	25 %	25 %	50 %	0 %	139472894
129	NC_009332	TGA	2	6	6556	6561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472894
130	NC_009332	ACG	2	6	6610	6615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	139472894
131	NC_009332	TTCAGG	2	12	6735	6746	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	139472894
132	NC_009332	CTG	2	6	6840	6845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	139472894
133	NC_009332	TAA	2	6	6865	6870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	139472894
134	NC_009332	ATG	2	6	6876	6881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	139472894
135	NC_009332	AGA	2	6	6922	6927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	139472894
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